一般来说，污水中磷含量过高的主要原因有三个：
（1）由于污水本身，进水区总磷浓度过高，远远超过总磷排放标准。
生活污水中磷过量：生活污水中的磷主要来自洗涤剂、含磷洗衣粉和人类粪便。这种水的总磷浓度不高，原水的浓度一般在15mg/l左右，基本上是无机磷。
酸洗磷化和阳极氧化废水中磷超标：酸洗磷化和阳极氧化废水的总磷含量非常高，几百毫克/升甚至几千毫克/升，基本上都是无机磷。
化学镀镍废水中磷超标：电镀工艺包括电镀和化学镀，次磷酸钠等还原剂作为化学镀剂，导致化学镀废水中排放的磷浓度较高，主要是次磷酸盐（有机磷）。
（2）没有除磷工艺，过去的旧工艺没有对污水进行全磷处理的要求，基本上没有脱磷环节的设计。随着环保要求的提高，旧工艺已无法满足排放要求。
（3）有除磷过程，但没有很好的护理。好氧段聚磷菌太少，无法吸入大量溶解磷，除磷效果一般，最终污水中总磷仍达不到标准。
附：多磷酸盐细菌的除磷机理
磷酸盐菌又称磷菌和除磷菌，是传统活性污泥工艺中的特殊菌种，广泛用于生物除磷。
在好氧状态下，恢复多磷酸菌的活力，以多磷的形式储存超过生长所需量的磷量，通过PHB的氧化代谢产生能量，用于磷的吸收和多磷的合成，能量以多磷酸盐高能键的形式捕获和储存， 并从水中除去磷酸盐。